Diyanet İşleri Başkanlığı tarafından Halil Konakçı'ya soruşturma başlatıldı. Konakçı Hatay hakkında yaptığı açıklamada ''Hatay’ın çoğunluğu Arap’tır'' demiş be büyük tepkilere maruz kalmıştı.
Halil Konakçı Konakçı’nın sosyal medyadan paylaşılan videosunda şu ifadeler yer alıyordu: “Hatay’ın çoğunluğu Arap’tır. Kürt ve Arap kardeşlerimiz var orada. Hala da öyle. O zaman da öyleydi. 1938’e kadar Fransız işgalindeydi. Sınırın içinde mi kalsın dışında mı kalsın tartışmaları vardı. Ezan yasağı 1932’de geldi. Fransızlar, ezanı Hatay’daki Müslüman köylerinde, camilerinde yasaklamadılar. Yine Fransız işgalindeki Hatay merkezinde, köylerinde ezan ‘Allahu ekber’ diye okundu 1938’e kadar. 1938’de Hatay Türkiye topraklarına katıldığında ilk yapılan iş ezanın yasaklanması oldu. Yani Fransız’ın yapmadığı zulmü bu topraklarda yaptılar.” Diyanet, bu paylaşımı nedeniyle Halil Konakçı hakkında inceleme başlattı.